From 7751395af224bab828d1c45c3b514531da11f2ed Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: bay9355 <mia.le@studium.uni-hamburg.de>
Date: Tue, 14 Mar 2023 16:06:00 +0100
Subject: [PATCH] activated all cami_approaches
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cami_src/cami_suite.py | 74 +++++++++++++++++++++---------------------
1 file changed, 37 insertions(+), 37 deletions(-)
diff --git a/cami_src/cami_suite.py b/cami_src/cami_suite.py
index c1d13d5..91958a6 100644
--- a/cami_src/cami_suite.py
+++ b/cami_src/cami_suite.py
@@ -296,46 +296,46 @@ class cami():
result_sets[tool] -= set(self.seed_lst)
camis = {
- # 'cami_v1': {'function': cami_v1.run_cami, 'params': {'consens_threshold': consens_threshold}},
- # 'cami_v2_param1_tr': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
- # 'hub_penalty': 0.8, 'damping_factor': 0.5, 'confidence_level': 0.75
- # }},
- # 'cami_v2_param1_bc': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
- # 'hub_penalty': 0.8, 'damping_factor': 0.5, 'confidence_level': 0.75, 'ranking': 'betweenness'
- # }},
- # 'cami_v2_param1_m': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
- # 'hub_penalty': 0.8, 'damping_factor': 0.5, 'confidence_level': 0.75, 'ranking': 'must'
- # }},
- # 'cami_v2_param2_tr': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
- # 'hub_penalty': 0, 'damping_factor': 0.7, 'confidence_level': 0.5
- # }},
- # 'cami_v2_param2_m': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
- # 'hub_penalty': 0, 'damping_factor': 0.7, 'ranking': 'must',
- # }},
- # 'cami_v2_param2_bc': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
- # 'hub_penalty': 0, 'damping_factor': 0.7, 'confidence_level': 0.5, 'ranking': 'betweenness'
- # }},
- # 'cami_v3_param1_tr': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
- # 'hub_penalty': 0.8, 'damping_factor': 0.5, 'confidence_level': 0.75
- # }},
- # 'cami_v3_param1_bc': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
- # 'hub_penalty': 0.8, 'damping_factor': 0.5, 'confidence_level': 0.75, 'ranking': 'betweenness'
- # }},
+ 'cami_v1': {'function': cami_v1.run_cami, 'params': {'consens_threshold': consens_threshold}},
+ 'cami_v2_param1_tr': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
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+ }},
+ 'cami_v2_param1_bc': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
+ 'hub_penalty': 0.8, 'damping_factor': 0.5, 'confidence_level': 0.75, 'ranking': 'betweenness'
+ }},
+ 'cami_v2_param1_m': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
+ 'hub_penalty': 0.8, 'damping_factor': 0.5, 'confidence_level': 0.75, 'ranking': 'must'
+ }},
+ 'cami_v2_param2_tr': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
+ 'hub_penalty': 0, 'damping_factor': 0.7, 'confidence_level': 0.5
+ }},
+ 'cami_v2_param2_m': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
+ 'hub_penalty': 0, 'damping_factor': 0.7, 'ranking': 'must',
+ }},
+ 'cami_v2_param2_bc': {'function': cami_v2.run_cami, 'params': {
+ 'hub_penalty': 0, 'damping_factor': 0.7, 'confidence_level': 0.5, 'ranking': 'betweenness'
+ }},
+ 'cami_v3_param1_tr': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
+ 'hub_penalty': 0.8, 'damping_factor': 0.5, 'confidence_level': 0.75
+ }},
+ 'cami_v3_param1_bc': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
+ 'hub_penalty': 0.8, 'damping_factor': 0.5, 'confidence_level': 0.75, 'ranking': 'betweenness'
+ }},
'cami_v3_param1_m': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
'hub_penalty': 0.8, 'damping_factor': 0.5, 'confidence_level': 0.75, 'ranking': 'must'
}},
- # 'cami_v3_param2_tr': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
- # 'hub_penalty': 0, 'damping_factor': 0.7, 'confidence_level': 0.5, 'ranking': 'trustrank'
- # }},
- # 'cami_v3_param2_bc': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
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- # }},
- # 'cami_v3_param2_m': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
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- # }},
- # 'cami_v3_param3_m': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
- # 'hub_penalty': 0, 'damping_factor': 0.7, 'confidence_level': 0.5, 'ranking': 'must', 'trees': 15
- # }},
+ 'cami_v3_param2_tr': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
+ 'hub_penalty': 0, 'damping_factor': 0.7, 'confidence_level': 0.5, 'ranking': 'trustrank'
+ }},
+ 'cami_v3_param2_bc': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
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+ }},
+ 'cami_v3_param2_m': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
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+ }},
+ 'cami_v3_param3_m': {'function': cami_v3.run_cami, 'params': {
+ 'hub_penalty': 0, 'damping_factor': 0.7, 'confidence_level': 0.5, 'ranking': 'must', 'trees': 15
+ }},
}
# create integer codes for cami_versions (needed for predicted_by vertex property)
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