diff --git a/SL_Input_16S/Batch1-31.07.23_470_Track_reads_through_pipeline.csv b/SL_Input_16S/Batch1-31.07.23_470_Track_reads_through_pipeline.csv deleted file mode 100644 index 6046db9f8f9464726e4e61f9b7d56b88db531c3c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/SL_Input_16S/Batch1-31.07.23_470_Track_reads_through_pipeline.csv +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -;input;filtered;denoisedF;denoisedR;merged;nonchim -SLSU21BBEB7;8543;6385;6294;6359;6103;5808 -SLSU21MGEB7;30243;22686;22440;22557;21842;21517 -SLSU21MLEB9;28382;21758;21230;21643;20011;18276 -SLSU21SSEB9;22227;16889;16709;16805;16259;15750 -WFSU21MLFL;48643;34031;27782;32240;20380;17490 -WFSU21SSFL;12563;8763;7388;8447;5641;4839 \ No newline at end of file diff --git a/SL_Input_16S/Batch1-Reseq-31.07.23_470_Track_reads_through_pipeline.csv b/SL_Input_16S/Batch1-Reseq-31.07.23_470_Track_reads_through_pipeline.csv deleted file mode 100644 index 66b50ec3d630d947781757ef3beb89f955a8df03..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/SL_Input_16S/Batch1-Reseq-31.07.23_470_Track_reads_through_pipeline.csv +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -;input;filtered;denoisedF;denoisedR;merged;nonchim -SLSU21BBEB7;4982;4223;4169;4190;3988;3826 -SLSU21MGEB7;16462;13924;13726;13807;13254;13085 -SLSU21MLEB9;15992;13931;13552;13843;12733;11817 -SLSU21SSEB9;12832;11164;10996;11111;10614;10276 -WFSU21MLFL;26502;21401;17088;20414;12541;11049 -WFSU21SSFL;6996;5641;4696;5441;3537;3151 \ No newline at end of file diff --git a/SL_Input_16S/Batch2-15.09.23_470_Track_reads_through_pipeline.csv b/SL_Input_16S/Batch2-15.09.23_470_Track_reads_through_pipeline.csv deleted file mode 100644 index f3140e80aa7968991d20476dd6babb213f8a37fb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/SL_Input_16S/Batch2-15.09.23_470_Track_reads_through_pipeline.csv +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -;input;filtered;denoisedF;denoisedR;merged;nonchim -Elbe915;21146;21143;18695;20345;15505;15127 -Elbe917;22015;22015;18443;20893;14191;13632 -SLSU21BBEB1;19529;18747;18338;18730;18162;17696 -SLSU21BBEB2;29373;28184;28072;28127;27812;26718 -SLSU21BBEB4;9031;8713;8676;8700;8594;7968 -SLSU21BBEB6;11196;10750;10704;10723;10598;10394 -SLSU21BBEB7;6035;5755;5692;5744;5623;5286 -SLSU21BBEB9;86151;82613;80870;82484;78937;73840 -SLSU21MGEB1;41878;40287;33047;40181;32031;27076 -SLSU21MGEB2;18102;17407;17156;17332;16848;16268 -SLSU21MGEB3;26254;25316;24879;25305;24727;22224 -SLSU21MGEB4;19491;18816;18659;18780;18451;18049 -SLSU21MGEB5;13638;13171;13065;13128;12919;12652 -SLSU21MLEB1;13704;13141;13020;13098;12738;12519 -SLSU21MLEB2;48037;46292;45676;45427;43206;39162 -SLSU21MLEB5;35691;34287;33978;34217;33013;31939 -SLSU21MLEB6;36925;35529;35272;35484;34857;33049 -SLSU21MLEB7;18010;17337;17168;17275;16881;16090 -SLSU21SSEB2;16533;15943;15818;15873;15576;15096 -SLSU21SSEB3;36809;35399;34955;35276;34003;33057 -SLSU21SSEB5;14203;13574;13294;13529;12871;11522 -SLSU21SSEB6;23628;22621;22589;22614;22284;21584 -SLSU21SSEB7;16890;16183;16130;16164;15949;14779 \ No newline at end of file diff --git a/SL_Input_16S/SL_04.01.2024_Taxa_Species.rds b/SL_Input_16S/SL_04.01.2024_Taxa_Species.rds deleted file mode 100644 index 714eb0a40fa6c24b4a58cf27827be856f7a4ff7a..0000000000000000000000000000000000000000 Binary files a/SL_Input_16S/SL_04.01.2024_Taxa_Species.rds and /dev/null differ diff --git a/SL_Input_16S/SL_04.01.2024_seqtab.nochim.rds b/SL_Input_16S/SL_04.01.2024_seqtab.nochim.rds deleted file mode 100644 index 896ce20446e379becd6268937045f211743aa85d..0000000000000000000000000000000000000000 Binary files a/SL_Input_16S/SL_04.01.2024_seqtab.nochim.rds and /dev/null differ