removed Processing_test_doi_ueberarbeitet.py

verarbeitung/Processing_test_doi_ueberarbeitet.py

-# -*- coding: utf-8 -*-
-"""
-Created on Wed Nov  3 16:54:43 2021
-
-@author: Malte Schokolowski
-"""
-
-from bs4 import BeautifulSoup as bs
-import requests as req
-import sys  
-from pathlib import Path
-from input_fj import input
-from json_demo import output_to_json
-
-
-
-def process_main(doi_input_array, depth):
-    # ERROR-Handling doi_array = NULL
-    if (len(doi_input_array) == 0):
-        print("Error, no input data")
-
-    # ERROR- wenn für die Tiefe eine negative Zahl eingegeben wird
-    if (depth < 0):
-        print("Error, depth of search must be positive")
-    
-
-    # Leeres Array für die Knoten(nodes) wird erstellt.
-    # Leeres Array für die Kanten(edges) wird erstellt.
-    global nodes, edges
-    nodes = []
-    edges = []
-    
-    # Jede Publikation aus dem Input-Array wird in den Knoten-Array(nodes) eingefügt.
-    for pub_doi in doi_input_array:
-        pub = input(pub_doi)
-        not_in_nodes = True
-        for node in nodes:
-            if (pub.doi_url == node.doi_url):
-                not_in_nodes = False
-                break
-        if (not_in_nodes):
-            nodes.append(pub)
-        else:
-            doi_input_array.remove(pub_doi)
-
-    process_rec_depth(doi_input_array, 0, depth)
-
-    output_to_json(nodes,edges)
-    return(nodes,edges)
-    
-    
-def process_rec_depth(array, depth, depth_max):  
-    # Die Tiefe wird bei jedem rekursiven Aufruf um 1 erhöht.
-    depth += 1
-
-    # Für jede Publikation im Input-Array wird ein Klassenobjekt erstellt.
-    for pub_doi in array:
-        pub = input(pub_doi)
-
-        # Für jede citation, die in der entsprecheneden Klasseninstanz der Publikation gespeichert sind, 
-        # wird geprüft, ob diese bereits als Knoten existiert.
-        for citation in pub._citations:
-
-            # Wenn die citation noch nicht im Knoten-Array(nodes) existiert UND die maximale Tiefe 
-            # noch nicht erreicht wurde, wird diese als Knoten im Knoten-Array gespeichert. Zusätzlich 
-            # wird die Verbindung zur Publikation als Tupel im Kanten-Array(edges) gespeichert. 
-            not_in_nodes = True
-            for node in nodes:
-                if (citation.doi_url == node.doi_url):
-                    not_in_nodes = False
-                    break
-            if (not_in_nodes):
-                if (depth <= depth_max):
-                    nodes.append(citation)
-                    edges.append([pub.doi_url,citation.doi_url])
-
-            # Wenn die citaion bereits im Knoten-Array existiert, wird nur die Verbindung zur Publikation 
-            # als Tupel im Kanten-Array(edges) gespeichert.            
-            else:
-                edges.append([pub.doi_url,citation.doi_url])
-            
-        # Wenn die maximale Tiefe noch nicht erreicht wurde, werden alle citations aus der Publikation 
-        # in ein Array geschrieben und mit diesem die Funktion erneut aufgerufen.      
-        if (depth < depth_max):
-            cit_arr = []
-            for citation in pub._citations:
-
-                # Momentan werden nur die citations mit acs in der URL gespeichert, da wir von anderen 
-                # Quellen die Infotmationen nicht extrahieren können.
-                if ("acs" in citation.doi_url):
-                    cit_arr.append(citation.doi_url)
-
-            # Rekusriver Aufruf der Funktion.
-            process_rec_depth(cit_arr, depth, depth_max)
-            
- 
-    
-# Programmtest, weil noch keine Verbindung zum Input besteht.
-arr = []
-arr.append('https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.9b00249')
-arr.append('https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.9b00249')
-arr.append('https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.0c01332')
-#arr.append('https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00741')
-
-#arr.append('https://doi.org/10.1021/ci700007b')
-#arr.append('https://doi.org/10.1021/acs.jcim.5b00292')
-#url = sys.argv[1]
-#arr.append[url]
-
-nodes,edges = process_main(arr,1)
-
-print("Knoten:\n")
-for node in nodes:
-    print(node.title, "\n")
-print("\nKanten:\n")
-for edge in edges:
-    print(edge,"\n")
\ No newline at end of file